Vattendetektiver är ett initiativ av Norra Möre Vattenråd, Ljungbyåns Vattenråd och Hagbyåns-Halltorpsåns Vattenråd (Ostkustens Vattensamling). Verksamheten drivs av vattenrådskansliet vid Kalmar kommun.

Mellan 2016 och 2019 har verksamheten fått bidrag från LONA (statliga bidrag till lokala naturvårdsprojekt), SydostLeader och Kalmar kommun.